בישיבת "מאיר הראל" יש דגשים לימודיים יחודיים ויחודיות בעבודת ד'.
החידוש של ישיבת ההסדר "מאיר הראל" מודיעין בעולם הישיבות, הוא מסלול ה"שסדר".
במסלול זה הוארך פרק לימוד התורה ופרק השירות הצבאי. המסלול מאפשר ומעודד לשלב את לימוד התורה עם פיקוד וקצונה.
התוצאות לא מאחרות לבוא וכיום, 11 שנים מהקמת הישיבה, לצד חבורה רצינית שממשיכה בלימוד רב שנים ובלימודי רבנות, כשני שליש יצאו לפיקוד וקצונה. השירות הצבאי הינו מפוצל ולכך יש יתרונות רבים. הוא מאפשר פרק של לימוד איכותי בין פרקי השרות, וכן אגירת כוחות תורניים לקראת השרות השני.
ישיבת "מאיר הראל" היא ישיבת הסדר "קהילתית" שרואה עצמה כחלק מהנוף הטבעי של העיר מודיעין ואף יוזמת פעילויות רבות כדי להשפיע ולהיות חלק מהתפתחותה של עיר החשמונאים.
פעילויות אלו נועדו להפיח רוח של תורה וציונות במודיעין וכן לסייע למערך קליטת העלייה המבורכת בעיר. השיתוף בין הישיבה לבין תושבי העיר, דתיים כחילוניים מניבה פירות יפים ורבים מילדי מודיעין והוריהם רואים בישיבה כתובת של חינוך וערכים.
כיום מונה ישיבת "מאיר הראל" מודיעין כ-100 תלמידים ואברכים. הישיבה שואפת להיות מיגדלור של תורה ורוח במרכז הארץ ואבן שואבת של תורה ועשייה בעיר מודיעין וסביבותיה.
לשם כך התחלנו בתכנון והקמת מבני קבע של בית מדרש, כיתות ופנימיות.
